水冷机型使用中的冷却效果完全依赖于冷却水系统，如果业主企业的冷却水系统运转正常，则冷却效果非常稳定可靠。风冷受环境温度及安装环境的影响较大，但通常制造企业设计时已经考虑到了极端情况，所以按照要求安装，也都能达到满意的冷却效果。
水冷空压机在冷却过程中无须用电设备，不占用空压机本身的能源消耗，而风冷空压机则需要配备冷却风扇，占用的是空压机本体的能源消耗。
水冷换热效率高，体积小，较风冷结构上更为简洁和紧凑，另外由于风冷有散热风扇，工作时风噪较大，故水冷较风冷型机器整机噪声更低。
空压机油需要在机体内无限循环，起到热量搬运工的作用，将主机压缩过程中空气被压缩释放出的热量及其他热量带到冷却器中，由冷介质带走。
风冷空压机几乎都采用板翅式冷却器，一般小功率空压机通常将空冷和油冷做成一体，一部分冷却压缩空气，一部分冷却润滑油。而水冷空压机几乎都采用管壳式分油冷冷却器和空冷冷却器。
风冷的板翅式冷却器为铝或铝合金材质钎焊制成，高温的油和压缩空气在冷却器内流动，通过散热风扇强制对流将热量带走。
水冷的管壳式冷却器，热介质为高温的油和压缩空气，冷介质为冷却循环水。通过热交换，将热量由冷却水带走。
